本期為大家?guī)淼氖腔蚺c人類疾病相關(guān)領(lǐng)域的研究進(jìn)展，希望讀者朋友們能夠喜歡。

1. Retrovirology：整合到人基因組中的古老逆轉(zhuǎn)錄病毒有助抵抗HIV-1感染

doi:10.1186/s12977-017-0351-8

在我們的進(jìn)化過程中，病毒持續(xù)地感染人體。一些早期的病毒已整合到我們的基因組中，如今它們被稱作為人內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒（human endogenous retroviruses, HERV）。在上百萬年來，它們因它們的遺傳密碼發(fā)生突變或較大的缺失而變得沒有活性。如今，作為研究得zui多的HERV家族之一是HERV-K家族，該家族自從人類和黑猩猩在進(jìn)化上分開以來就變得活躍，而且它的一些成員在過去幾十萬年里可能活躍地感染人類。

HERV成為HIV研究人員的關(guān)注目標(biāo)是因?yàn)橐延醒芯孔C實(shí)在那些HIV感染者中，T細(xì)胞產(chǎn)生抵抗HERV的免疫反應(yīng)。如今，據(jù)認(rèn)為HERV表達(dá)是由HIV感染導(dǎo)致的，而且通過靶向HERV抗原而不是不斷發(fā)生突變的HIV抗原，HIV將變成一種更容易的靶標(biāo)。在提出這種看法之后，日本熊本大學(xué)之前開展的一項(xiàng)研究已揭示出HIV-1組特異性抗原（group specific antigen, Gag）和HERV-K Gag共組裝與HIV-1顆粒增殖能力和感染性下降存在明顯的關(guān)聯(lián)性。在當(dāng)前的一項(xiàng)新的研究中，來自熊本大學(xué)的這些研究人員尋求闡明HERV-K Gag如何以這種方式影響HIV-1。

他們報道在早期的共組裝階段，HERV-K Gag改變后代HIV-1顆粒的大小和形態(tài)。這發(fā)生的原因在于HERV-K Gag衣殼（即HERV-K病毒蛋白衣殼）部分上與HIV-1 Gag在細(xì)胞膜上共定位（或者說重疊）。這也會導(dǎo)致成熟的HIV-1顆粒數(shù)量下降、HIV-1更慢地釋放和感染性下降。相關(guān)研究結(jié)果近期發(fā)表在Retrovirology期刊上，論文標(biāo)題為"Molecular mechanisms by which HERV-K Gag interferes with HIV-1 Gag assembly and particle infectivity"。

論文通信作者、熊本大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院微生物學(xué)系項(xiàng)目Kazuaki Monde博士說，"盡管我們發(fā)現(xiàn)HIV-1顆粒的釋放效率和感染性受到HERV-K Gag的阻礙，但是它們似乎是由兩種不同的機(jī)制導(dǎo)致的。也表達(dá)HERV-K Gag的細(xì)胞釋放HIV-1顆粒的能力顯著下降，但是HIV-1感染性如何也會下降的細(xì)節(jié)仍然讓我們困惑。當(dāng)然，還需針對HERV-K Gag衣殼開展更多的研究以便確定它如何能夠降低HIV-1顆粒釋放和感染性。"

2. Cell：zui大規(guī)模基因功能分析揭示出很多潛在的抗瘧疾藥物靶標(biāo)

doi:10.1016/j.cell.2017.06.030

在對瘧原蟲基因功能的*有史以來大規(guī)模的研究中，來自英國韋爾科姆基金會桑格研究所等研究機(jī)構(gòu)的研究人員發(fā)現(xiàn)瘧原蟲的成功歸結(jié)于將它的基因組縮小到僅由必需基因組成。他們分析了這種瘧原蟲基因組中的一半以上的基因，結(jié)果發(fā)現(xiàn)三分之二的這些基因是它的存活所*的。這也是迄今為止在研究過的任何一種有機(jī)體中發(fā)現(xiàn)的zui大比例的必需基因。這些結(jié)果鑒定出很多潛在靶標(biāo)可用于新的抗瘧疾藥物開發(fā)。對于這種很少理解的存在嚴(yán)重耐藥性問題的瘧原蟲而言，這是一項(xiàng)重大的發(fā)現(xiàn)。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2017年7月13日的Cell期刊上，論文標(biāo)題為"Functional Profiling of a Plasmodium Genome Reveals an Abundance of Essential Genes"。

瘧原蟲的基因功能是很難理解的。它是古老的有機(jī)體，而且它的大約一半的基因在任何其他的有機(jī)體中沒有同源基因，這就使得科學(xué)家們很難發(fā)現(xiàn)關(guān)于它們的功能的線索。這項(xiàng)研究是迄今為止提供證據(jù)證實(shí)了大多數(shù)的這些基因的功能。

科學(xué)家們已研究了一種被稱作伯氏瘧原蟲（Plasmodium berghei）的瘧原蟲的基因，這些基因在它的復(fù)雜的多階段生命周期的單個血液階段中表達(dá)。在這項(xiàng)新的研究中，這些研究人員設(shè)計(jì)出一種新的方法來破譯這種瘧原蟲的基因功能。他們敲除了2578個基因（占這種瘧原蟲基因組的一半以上），然后給每種基因敲除設(shè)計(jì)一個*的DNA條形碼。

這些研究人員隨后利用下一代基因組測序技術(shù)對這些條形碼進(jìn)行計(jì)數(shù)，因而測量了每個基因修飾的瘧原蟲蟲株的生長。如果被敲除的基因不是必需的，那么這種瘧原蟲數(shù)量激增，但是如果被敲除的基因是必需的，那么這種瘧原蟲就會消失。

這些研究人員系統(tǒng)性地證實(shí)這種瘧原蟲能夠很容易地清除所編碼的蛋白會讓宿主免疫系統(tǒng)知道它的存在的基因。這就給開發(fā)瘧疾疫苗帶來問題，這是因?yàn)檫@種瘧原蟲能夠很快地改變它的外觀來逃避人免疫系統(tǒng)的檢測，也因此它能夠?qū)Ο懠惨呙绠a(chǎn)生抵抗性。

這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)了更多*的瘧疾藥物靶標(biāo)。zui高目標(biāo)就是發(fā)現(xiàn)在這種瘧原蟲生命周期的所有階段都是必需的基因。如果人們能夠利用藥物靶向這些基因，那么就會讓瘧原蟲無處可逃。

3. Genome Biol：科學(xué)家利用新型技術(shù)繪制基因圖譜 有望改善癌癥診斷

DOI: 10.1186/s13059-017-1253-8

基因組結(jié)構(gòu)的大規(guī)模改變通常在癌細(xì)胞中比較常見，近日來自英國巴布拉漢研究所(Babraham Institute)的研究人員通過研究就發(fā)現(xiàn)了一種能夠檢測這些改變的新方法，相關(guān)研究刊登于雜志Genome Biology上，該研究或?yàn)楹笃谘芯咳藛T開發(fā)增強(qiáng)癌癥診斷的新方法及癌癥新型靶向療法提供新的思路和希望。

這篇研究報告中，研究者描述了一種名為Hi-C技術(shù)的新應(yīng)用，這種技術(shù)能夠幫助研究人員繪制出遺傳物質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)部的排列方式和機(jī)制，通過對相關(guān)信息進(jìn)行分析，研究人員就能夠可靠地鑒別出其它方法可能會錯過的一些主要的遺傳改變，相比標(biāo)準(zhǔn)的DNA測序方法而言，這種方法的成本較低。

Hi-C能夠?qū)θ旧w的重排進(jìn)行檢測，染色體重排，即大片段DNA發(fā)生交換或者在染色體的片段間移動；同時這種技術(shù)還能夠?qū)截悢?shù)變異進(jìn)行檢測，即遺傳物質(zhì)的拷貝或剔除情況，所有這些改變都會對細(xì)胞的行為產(chǎn)生劇烈的影響。研究者Louise Harewood博士表示，在一般人群和大部分癌癥患者中我們都能夠看到染色體的重排現(xiàn)象，對患者機(jī)體的染色體重排進(jìn)行檢測往往非常麻煩，而且有時候很容易錯過，當(dāng)然這或許是非常不利的，尤其是在腫瘤學(xué)領(lǐng)域中，因?yàn)槿旧w重排往往扮演著診斷和患者預(yù)后的角色。

研究者Peter Fraser教授指出，這項(xiàng)研究中，我們對6名腦瘤患者的腫瘤組織進(jìn)行分析，利用Hi-C技術(shù)對癌細(xì)胞的基因組進(jìn)行了檢測，zui終鑒別出了主要的基因組改變；未來這種方法或許就能夠幫助醫(yī)生和科學(xué)家們在全基因組的廣泛背景下研究遺傳改變，Hi-C技術(shù)也將會成為一種強(qiáng)有力的工具幫助理解多種癌癥中復(fù)雜的遺傳改變。

zui后，研究者表示，Hi-C技術(shù)在檢測染色體異常上扮演著關(guān)鍵角色，而且其還能夠幫助發(fā)現(xiàn)基因組中的新型融合基因，相比當(dāng)前技術(shù)而言，該技術(shù)還能夠?qū)|(zhì)量較低的樣本進(jìn)行檢測，同時也能夠通過相同的數(shù)據(jù)提供拷貝相同的信息，相比當(dāng)前使用的DNA測序標(biāo)準(zhǔn)方法而言，這種新技術(shù)的成本將會大大降低。

4. Cell：2型糖尿病產(chǎn)生新發(fā)現(xiàn)！SLC16A11基因變異通過兩種不同的機(jī)制破壞其在肝細(xì)胞中的功能

doi:10.1016/j.cell.2017.06.011

在對早前的針對拉丁美洲人的2型糖尿病（type 2 diabetes, T2D）全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）中的發(fā)現(xiàn)進(jìn)行跟蹤研究后，來自美國布羅德研究所和麻省總醫(yī)院等研究人員將這項(xiàng)研究中檢測到的一種關(guān)聯(lián)性追蹤到一個特定基因（即基因SLC16A11）的變異體上，并且發(fā)現(xiàn)這些變異體利用兩種不同的機(jī)制破壞該基因在肝細(xì)胞中的功能，從而可能導(dǎo)致T2D產(chǎn)生。這些發(fā)現(xiàn)對T2D的生物學(xué)性質(zhì)提供新的認(rèn)識，并且為開發(fā)治療這種疾病的藥物提供新的線索。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2017年6月29日的Cell期刊上，論文標(biāo)題為"Type 2 Diabetes Variants Disrupt Function of SLC16A11 through Two Distinct Mechanisms"。論文通信作者為布羅德研究所代謝項(xiàng)目聯(lián)合主任、哈佛醫(yī)學(xué)院副教授、麻省總醫(yī)院糖尿病部門主任Jose Florez和布羅德研究所創(chuàng)始主任Eric Lander。論文*作者為布羅德研究所前哈佛醫(yī)學(xué)院研究生（如今在Jnana治療公司任職）Victor Rusu和布羅德研究所博士后研究員Eitan Hoch。

2型糖尿病是一種影響著身體如何處理血糖的慢性代謝疾病。盡管環(huán)境因素在T2D產(chǎn)生中發(fā)揮著作用，但是這種疾病也是高度遺傳性的，不過所涉及的遺傳性是復(fù)雜的，這是因?yàn)楹芏嗷蚨紩?dǎo)致這種疾病風(fēng)險。盡管在確定T2D的遺傳構(gòu)成上已取得進(jìn)展，但是人們對不同類型的基因變異如何可能導(dǎo)致這種疾病仍然知之甚少。

在*，T2D影響著4億多人，但是對某些人群（比如拉丁美洲裔人群患上這種疾病的可能性是歐洲裔人群的2倍）的影響尤其嚴(yán)重。

作為美洲基因組醫(yī)學(xué)瘦身計(jì)劃（Slim Initiative in Genomic Medicine for the Americas）2型糖尿病聯(lián)盟（Slim Initiative in Genomic Medicine for the Americas T2D Consortium）的一部分，布羅德研究所糖尿病研究組的研究人員猜測這種影響的不一致性可能有助揭示這種疾病的遺傳學(xué)基礎(chǔ)，并且與早前的全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）的合作機(jī)構(gòu)攜手從來自墨西哥和美國的9000多名拉美裔人的DNA樣品中發(fā)現(xiàn)了T2D的遺傳決定因子。之前的研究關(guān)注歐洲裔人群。

他們?nèi)〉玫陌l(fā)現(xiàn)之一是人基因組的一個特定區(qū)域發(fā)生的變異與糖尿病風(fēng)險增加大約30%相關(guān)聯(lián)。這種變異在非洲不存在，在歐洲比較罕見，但是在美洲較為常見，而且它解釋了拉丁美洲裔人群T2D發(fā)生率增加的20%。但是發(fā)現(xiàn)一種關(guān)聯(lián)僅是理解遺傳學(xué)在這種疾病產(chǎn)生中發(fā)揮作用的*步。

即便關(guān)注一個特定的基因也充滿挑戰(zhàn)，在GWAS研究中發(fā)現(xiàn)的每個位點(diǎn)橫跨多個基因。2013年，由David Altshuler（如今是Vertex制藥公司的科學(xué)家）領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)研究已證實(shí)存在于這個區(qū)域中的基因SLC16A11攜帶著幾種可疑的突變，而且對該區(qū)域進(jìn)行更加詳細(xì)的遺傳作圖強(qiáng)化了人們對它的關(guān)注。然而，這個基因可能在T2D中發(fā)揮的作用仍然是個謎。

這些研究人員在此之前并不知道SLC16A11發(fā)揮什么作用，在何處發(fā)揮作用。SLC16A11屬于一個已知轉(zhuǎn)運(yùn)分子通過細(xì)胞膜的基因家族，但是這些基因產(chǎn)生的蛋白能夠在體內(nèi)發(fā)揮著許多不同的作用，它們能夠在一些組織中是有活性的，但在其他的組織中是沒有活性的。他們不僅必須知道SLC16A11如何在正常情形下發(fā)揮功能，而且還需確定這個基因發(fā)生的突變?nèi)绾纹茐倪@種功能。特別地，他們需要確定"影響方向（direction of effect）"：基因活性是增加還是下降？理解這種功能將會針對這個基因在T2D中的潛在作用提供至關(guān)重要的線索。

通過一系列測試，這些研究人員發(fā)現(xiàn)SLC16A11基因發(fā)生的突變通過兩個不同的機(jī)制改變基因活性，而且都是按照相同的"影響方向"破壞這個基因的功能。SLC16A11基因中的一些變異僅是降低它在肝臟（作為一種器官，肝臟有助調(diào)節(jié)血糖水平，因而參與T2D產(chǎn)生）中的表達(dá)。這個基因中的其他變異破壞與另一種被稱作基礎(chǔ)免疫球蛋白（basigin, BSG）的蛋白之間的相互作用。這種破壞改變SLC16A11在細(xì)胞中的位置，阻止BSG蛋白發(fā)揮著一種轉(zhuǎn)運(yùn)體的作用，從而影響脂肪在肝臟中的處理方式。

Rusu解釋道，"為了確定破壞這個基因如何可能在疾病環(huán)境下發(fā)揮作用，我們采取化學(xué)手段敲除SLC16A11在人肝細(xì)胞中的活性。我們發(fā)現(xiàn)抑制這個基因表達(dá)會導(dǎo)致脂肪酸和脂質(zhì)代謝發(fā)生變化，這些變化讓人聯(lián)想起我們在胰島素耐受性和T2D中觀察到的情形。"

這些發(fā)現(xiàn)提示著恢復(fù)SLC16A11功能可能有益于治療T2D，從而為尋找治療藥物打開新的途徑。如果能夠發(fā)現(xiàn)，那么這些藥物可能不僅抵抗SLC16A11基因突變產(chǎn)生的影響，而且也潛在地抵抗任何可能通過類似機(jī)制觸發(fā)這種疾病產(chǎn)生的T2D相關(guān)變異。

5. Cancer：新技術(shù)可幫助鑒定男性前列腺癌相關(guān)基因突變

DOI: 10.1002/cncr.30817

盡管前列腺癌是目前困擾男性的zui嚴(yán)重的非皮膚性癌癥，研究者們對于前列腺癌的遺傳背景的了解卻十分有限。來自猶他健康大學(xué)的研究者們對前列腺癌患者進(jìn)行了分析，鑒定出了相關(guān)的遺傳突變特征，這些結(jié)果或許能夠幫助針對性療法的改進(jìn)以及評估患者親屬患前列腺癌的風(fēng)險。相關(guān)結(jié)果發(fā)表在zui近一期的《Cancer》雜志上。

該文章的作者，來自MD安德森癌癥中心的Pilié博士希望能夠基于前列腺患者的個人臨床病史，鑒定出相關(guān)的遺傳突變。該研究招募了102名被診斷患有前列腺癌的癌癥患者，他們同時患有至少一種其它類型的癌癥，例如黑色素瘤、胰腺癌、睪丸癌、霍奇金淋巴瘤等等。

利用下一代測序技術(shù)，研究者們分析了這群患者生殖系統(tǒng)的相關(guān)基因突變的頻率。結(jié)果顯示，有11%的患者在至少一類癌癥相關(guān)基因中存在突變現(xiàn)象，這表明這一遺傳突變或許導(dǎo)致了癌癥的發(fā)生。此外，通過對患者的個人以及家族病史進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)其中大部分患者（64%）并不滿足遺傳檢測的標(biāo)準(zhǔn)。這一發(fā)現(xiàn)表明，目前的遺傳檢測手段并不能夠有效地檢測出攜帶生殖細(xì)胞基因突變的前列腺癌患者的具體情況。

"這篇文章描述了通過分析多種癌癥（包括前列腺癌）的臨床病史從而鑒定患者是否攜帶生殖細(xì)胞基因突變的方法"。事實(shí)上，大部分有害的基因突變都與DNA的損傷修復(fù)有關(guān)，"這些基因的突變會阻礙DNA的自我修復(fù)，從而導(dǎo)致癌癥的發(fā)生"。Cooney說道。

"這一研究能夠幫助我們鑒定出具有患前列腺癌高風(fēng)險的人群，從而指導(dǎo)其盡早地接受診斷與治療"。

6. Nat Genet：單基因突變導(dǎo)致過敏性皮炎的發(fā)生

DOI: 10.1038/ng.3898

zui近，研究者們鑒定出了一類導(dǎo)致神經(jīng)性皮炎發(fā)生的關(guān)鍵基因突變：CARD11。來自美國NIH過敏與傳染病研究所的研究者們通過對四個沒有血緣關(guān)系的患病家庭進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)了這一導(dǎo)致疾病產(chǎn)生的基因、相關(guān)結(jié)果發(fā)表在《Nature Genetics》雜志上。此外，研究者們還發(fā)現(xiàn)通過補(bǔ)充谷氨酰胺能夠緩解該疾病的嚴(yán)重程度。

科學(xué)家們分析了患有嚴(yán)重神經(jīng)性皮炎的患者以及來自四個家庭中的攜帶CARD11突變基因的成員的基因組序列。他們發(fā)現(xiàn)這些志愿者中一些人存在其它的健康問題，但另外一些人則沒有相應(yīng)癥狀。這說明CARD11的突變引發(fā)的神經(jīng)性皮炎并不一定會導(dǎo)致其它嚴(yán)重疾病的發(fā)生。

接下來，研究者們希望了解CARD11突變對神經(jīng)性皮炎產(chǎn)生的具體影響。作者發(fā)現(xiàn)，這四個家庭雖然CARD11的突變方式不同（即它們的CARD蛋白發(fā)生突變的具體結(jié)構(gòu)域不同），但他們體內(nèi)的T細(xì)胞信號的傳遞都受到了影響。通過細(xì)胞培養(yǎng)的試驗(yàn)，作者發(fā)現(xiàn)上述兩條受影響的信號通路在人為添加了谷氨酰胺之后能夠得到恢復(fù)。

由于在體外培養(yǎng)這些T細(xì)胞的過程中，通過人為添加谷氨酰胺以刺激mTORC1的表達(dá)會恢復(fù)其中一條受到影響的信號傳遞通路，說明谷氨酰胺治療神經(jīng)性皮炎具有一定的潛力。如今，研究者們正計(jì)劃進(jìn)行一項(xiàng)有關(guān)補(bǔ)充谷氨酰胺以及亮氨酸對于激活mTORC1的試驗(yàn)，并探究這種方法治療神經(jīng)性皮炎的效果。

7. Cell：挑戰(zhàn)常規(guī)！上千個周圍基因影響大多數(shù)疾病

doi:10.1016/j.cell.2017.05.038

在對導(dǎo)致疾病的基因進(jìn)行研究中，一種核心假設(shè)是這些基因簇集在與這種疾病直接相關(guān)的分子通路中。但是在一項(xiàng)新的研究中，來自美國斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員指出事實(shí)并非如此。

這些研究人員發(fā)現(xiàn)細(xì)胞中的基因活性形成一種廣泛的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)以至于幾乎任何一個基因都能夠影響疾病。因此，大多數(shù)疾病的遺傳特征并不是歸因于少數(shù)核心基因（core gene）而是歸因于來自絕大多數(shù)周圍基因（peripheral gene）的微小貢獻(xiàn)。這些周圍基因在致病通路外發(fā)揮功能。這似乎表明任何給定的性狀并不是少數(shù)基因控制著的。相反，在基因組中，幾乎每個基因都會影響關(guān)于我們的一切。這些影響可能是微小的，但是它們產(chǎn)生累積效應(yīng)。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2017年6月15日的Cell期刊上，論文標(biāo)題為"An Expanded View of Complex Traits: From Polygenic to Omnigenic"。論文通信作者為斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)教授、生物學(xué)教授Jonathan Pritchard博士；博士后研究員Yang Li博士；研究生Evan Boyle。

這些研究人員將他們對致病性基因的易引起爭論的新理解稱為"全基因模型（omnigenic model）"，即幾乎任何一個基因都會影響疾病和其他的復(fù)雜性狀。Pritchard說，在任何一個細(xì)胞中，可能有50～100個核心基因?qū)σ环N給定的性狀產(chǎn)生直接的影響，而且在這個相同的細(xì)胞中表達(dá)的另外10000個周圍基因?qū)@種性狀產(chǎn)生間接的影響。

每個周圍基因都對這種性狀產(chǎn)生較小的影響。但是鑒于這些上千個周圍基因在數(shù)量上遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過核心基因，大多數(shù)與疾病相關(guān)的基因變異和其他的性狀是由這上千個周圍基因?qū)е碌摹Ｒ虼耍S刺的是，這些對疾病的影響zui為間接和比較小的周圍基因zui終導(dǎo)致大多數(shù)的疾病遺傳模式產(chǎn)生。

從多基因模型到全基因模型

Pritchard說，在此之前，他曾認(rèn)為遺傳上復(fù)雜的性狀遵循著一種多基因模型：不論這種性狀是身高或自閉癥等疾病，每個基因都對它產(chǎn)生直接的影響。

但是在去年，當(dāng)整理一篇針對北歐人近期進(jìn)化的論文時，Pritchard不得不反思這一觀點(diǎn)。

在早前針對身高遺傳學(xué)的研究中，Pritchard和他的同事們吃驚地發(fā)現(xiàn)整個基因組實(shí)際上都影響身高。他說，"這真地是違反直覺的。老實(shí)說，我曾認(rèn)為這很可能是錯誤的。"他的團(tuán)隊(duì)花了很長時間試圖理解這一令人吃驚的結(jié)果。

不過，他說，"我逐漸開始意識到這些數(shù)據(jù)并不真地符合這種多基因模型。我們開始思考，'如果整個基因組都參與身高等復(fù)雜性狀，那么這是如何做到的呢？'"

治療意義

這種多基因模型讓科學(xué)家們著重關(guān)注在已知影響疾病的分子通路中發(fā)揮功能的少數(shù)核心基因。因此，治療研究通常意味著解決這些核心基因。一種常見的基因發(fā)現(xiàn)方法是開展更大的全基因組關(guān)聯(lián)研究，但是Pritchard團(tuán)隊(duì)反對這種方法，這是因?yàn)楦蟮臉颖玖渴潜容^昂貴的，而且發(fā)現(xiàn)的這些上千個周圍基因可能具有微小的間接影響。Pritchard說，"在頭100次篩選后，很可能發(fā)現(xiàn)通過全基因組研究獲得的大多數(shù)核心基因。"

不過，他承認(rèn)對這些核心基因進(jìn)行深度測序來找出罕見的變異體可能具有更大的意義。Pritchard說，就臨床應(yīng)用而言，全基因組關(guān)聯(lián)研究仍然有其合理性：針對單個病人預(yù)測基于周圍基因的風(fēng)險因素以便開發(fā)出個人化療法。

對基礎(chǔ)科學(xué)的影響

Pritchard的全基因模型有望給基礎(chǔ)科學(xué)研究指出新的方向，而且意味著生物學(xué)家們還需要更多地了解將這上千個致病性周圍基因關(guān)聯(lián)在一起的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)。

8. Sci Adv：什么？特殊基因突變或能促進(jìn)男性長壽！

DOI: 10.1126/sciadv.1602025

近日，一項(xiàng)刊登在雜志Science Advances上的研究報告中，來自美國、法國和以色列的研究人員通過研究發(fā)現(xiàn)，生長激素受體基因突變或能夠使得某些男性壽命變得更長，文章中，研究者對多個不同的男性群體進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn)了生長激素受體外顯子3剔除后的差異。

生長激素是能夠連接細(xì)胞表面其它分子的特殊分子，其能夠促進(jìn)細(xì)胞加速生長，而且在某些情況下能夠釋放名為生長因子的分子；此前研究中，研究人員通過研究發(fā)現(xiàn)，對于某些人而言，機(jī)體中存在一種抑制特殊生長因子受體發(fā)育的遺傳突變，這種人仍然存在受體，但是形狀卻并不相同；本文中，研究人員希望通過研究來闡明生長激素受體外顯子3的突變剔除情況，通過研究他們還發(fā)現(xiàn)，這類男性或許平均能夠多活10年時間，而且平均還能長高一英寸。

文章中，研究人員首先對60歲以上的北歐猶太人人群及其后代（共567名個體）進(jìn)行研究，他們發(fā)現(xiàn)，在100歲以上的人群中，這種突變在12%的人群中都存在，而且攜帶這種突變的人群數(shù)量相當(dāng)于70歲男性的三倍多，攜帶該突變的男性往往能夠比不攜帶的個體而言平均多活10年，但在女性中卻無明顯差異。

研究者表示，這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)在所有研究組中都得到了相同的研究結(jié)果，他們認(rèn)為，外顯子3很明顯和機(jī)體長壽直接相關(guān)，盡管研究者很樂意承認(rèn)該基因僅是眾多因子中的一個；但是，如今相關(guān)的研究結(jié)果卻提示道，后期研究人員還需要在大型的研究人群中來證實(shí)本文的研究結(jié)果，如果也能夠得到相一致的研究結(jié)果，那么后期研究人員將會通過模擬生長激素受體基因的突變來觀察這是否能夠延長男性個體的壽命，并且使得攜帶突變的個體長得高一點(diǎn)。

9. Nat Genet：全基因組關(guān)聯(lián)性研究闡明誘發(fā)肺癌的新型易感位點(diǎn)

doi:10.1038/ng.3892

近日，一項(xiàng)刊登在雜志Nature Genetics上的研究報告中，來自多倫多大學(xué)等機(jī)構(gòu)的研究人員進(jìn)行了一項(xiàng)大型的全基因組關(guān)聯(lián)性研究，他們利用多個癌癥研究機(jī)構(gòu)所開發(fā)的基因分型平臺鑒別出了肺癌的新型易感性位點(diǎn)。

盡管吸煙是引發(fā)肺癌的主要風(fēng)險因子，但過去研究結(jié)果表明，肺癌的遺傳性或許占到了18%；當(dāng)然此前的全基因組關(guān)聯(lián)性研究中，研究人員也鑒別出了多個肺癌易感位點(diǎn)，但研究者對于大部分疾病遺傳性都無法解釋，本文研究中研究人員就在該項(xiàng)研究上取得了重大突破。

這項(xiàng)研究中，研究人員對有現(xiàn)有數(shù)據(jù)的歐洲個體進(jìn)行研究（包括14803名研究對象和12262名對照個體），zui終他們鑒別出了18個疾病易感位點(diǎn)，其中包括10個新型位點(diǎn)；這些新型位點(diǎn)能夠揭示出肺腺癌和鱗狀肺癌兩種肺癌亞型之間風(fēng)險模式的驚人變化，其中4個位點(diǎn)和總體的肺癌相關(guān)，6個位點(diǎn)和肺腺癌直接相關(guān)，研究者還發(fā)現(xiàn)，和端粒功能相關(guān)的多個基因的突變或許在誘發(fā)肺腺癌風(fēng)險上扮演著關(guān)鍵角色（并非鱗狀肺癌風(fēng)險）。

研究者Amos說道，讓我們非常激動的是這項(xiàng)研究的規(guī)模以及所發(fā)現(xiàn)的影響肺癌風(fēng)險的基因都是此前其他研究人員并未報道過的；本文研究或能幫助我們闡明影響肺癌風(fēng)險的新機(jī)制；尤其是研究人員鑒別出了多個影響細(xì)胞端粒功能的新型突變，這些突變能夠直接影響肺腺癌的風(fēng)險。

此外，研究者還發(fā)現(xiàn)，影響肺癌風(fēng)險的煙堿性受體亞單位周圍的突變以及吸煙似乎會對機(jī)體小腦產(chǎn)生一定的影響，研究人員很少發(fā)現(xiàn)小腦能夠參與影響機(jī)體的成癮行為；后期研究人員還需要進(jìn)行更為深入的研究來理解靶向基因在影響肺癌風(fēng)險、吸煙行為和吸煙效應(yīng)上所扮演的角色。